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在认识论上,非人类中心主义环境伦理学存在一个明显的逻辑矛盾：一方面,它特别强调自然的系统性和关联性，呼吁人们以整体主义的思维方式看待并处理人与自然的一体化关系。具有强烈的有机论色彩；而另一方面，为了赋予自身科学的“刚性”或“硬度”，它又不得不借助于生态科学的最新发现，借助于机械论的、还原论的、主客二分的思维方式，具有强烈的科学主义色彩。对现代思维方式的“知性”解读是导致这一困境的认识论根源。