2个四倍体栽培棉种冷胁迫响应基因的鉴定与比较分析

来源 :浙江大学学报(农业与生命科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:sdrtgwdrtwertwert
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为进一步发掘棉花中冷胁迫耐受性相关的基因,本研究利用2个四倍体栽培棉种陆地棉(Gossypium hirsutum)TM-1与海岛棉(G.barbadense)Hai7124,对冷处理(4℃)和对照处理(28℃)下不同阶段的叶片进行转录组测序,比较分析了二者冷胁迫响应基因的功能、表达模式和代谢途径的差异.结果显示:Hai7124比TM-1耐冷性差,植株表型受到冷胁迫时变化更快且更明显.转录组数据分析显示,TM-1中有8713个冷胁迫响应基因,Hai7124中有12461个冷胁迫响应基因.比较二者的直系同源基因发现,TM-1中有1518个特异受诱导基因,Hai7124中有3577个特异受诱导基因;对这些特异响应基因进行基因本体(gene ontology,GO)富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析发现,TM-1中特异响应基因更多地参与激素信号转导、昼夜节律等调控过程,而Hai7124中特异响应基因更多地参与赖氨酸、精氨酸、丝氨酸、苏氨酸等氨基酸代谢过程.此外,从TM-1和Hai7124中鉴定了脂肪酸合成途径的关键家族基因中的乙酰辅酶A羧化酶、脂肪酸合成酶、十八烷-ACP去饱和酶、脂肪酸去饱和酶、长链酰基辅酶A合成酶等,发现在整个冷胁迫处理过程中TM-1中有11个基因整体呈上调表达,而Hai7124中有10个基因整体呈下调表达;根据表达模式选取了5个冷胁迫响应基因,利用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real time quantitative reverse polymerase chain reaction,RT-qPCR)定量分析,发现其表达模式和转录组表达水平高度相关.本研究有助于解析陆地棉TM-1与海岛棉Hai7124种间冷胁迫耐受性差异响应基因,为培育耐冷性好、高产、优质的棉花新品种提供了重要的基因资源.
其他文献
目的 研究尖尾芋醇提物对荷瘤小鼠脾保护的作用机制.方法 C57BL/6小鼠背部右侧皮下接种黑色素瘤B16-F10细胞后,将未造模的6只小鼠作为正常组(normal),造模的30只小鼠随机分为模型组(model)、环磷酰胺组(CTX)和低、中、高剂量的尖尾芋醇提物组(lEAC、mEAC、hEAC),每组各6只.连续给药10 d,末次给药24 h后,小鼠眼球采血后颈椎脱臼处死,剥离脾组织并称重计算脏器指数,以苏木精-伊红(HE)染色观察脾组织的病理变化,以TUNEL荧光染色检测不同组小鼠脾组织中细胞凋亡的情况
[目的]为研究浏阳洞库3个不同香型陈化烟叶样品微生物多样性和群落组成差异.[方法]利用高通量测序对3个不同香型陈化烟叶样品微生物多样性、群落组成进行显著性差异分析,构建各样品微生物生态网络,并对各细菌群落进行功能预测.[结果](1)浏阳洞库3个不同香型陈化烟叶样品中细菌物种丰富,在门水平上主要由变形菌门和厚壁菌门组成,在属水平上微生物群落主要由鞘氨醇单胞菌属、丁酸杆菌属、假单胞菌属、黄单胞菌属、不动杆菌属、泛菌属、芽孢杆菌属和短波单胞菌属组成;(2)浏阳洞库3个不同香型陈化烟叶样品微生物多样性和群落组成均
对卷烟创新产品的工商交易进行预测,有助于调控工商企业微观层面市场策略,提升特色卷烟销量.选定影响工商交易量指标,采用灰色理论计算这些指标的关联矩阵,据此将指标分为5类,选取每类中与工商交易量关联度最大的指标形成指标集,运用XGBoost建立分析模型,进行结果预测.以近十年卷烟创新产品的工商交易数据为训练集和测试集,对XGBoost预测模型进行训练和测试,并与时间序列模型、多元回归模型和随机森林模型的结果进行对比.实验表明,4种模型的预测精度均在90%以上,以XGBoost为最佳,达到了96%的精度.因此,
浙江大学茶健康功效和资源综合利用团队由浙江大学农业与生物技术学院茶学系屠幼英教授等领衔,长期在茶叶生物化学、茶资源综合利用和健康功效领域深耕基础理论研究和成果转化,以培养创新性人才为导向,服务全国茶区建设工作.近10年来,团队与国内外知名大学教授(如日本渡边修治、美国Yi Charlie Chen和Chung S. Yang)合作,采用生物化学、细胞和分子生物学、化学工程、基础医学、食品营养学等多学科交叉的研究方法,取得了大量科研成果;在国内外发表学术论文300余篇,出版教材和专著20余部,获授权国家和国
期刊
[目的]从卷烟工业企业的角度对收购烟叶的等级质量进行分析和评价,引导烟叶基地单元生产和收购的烟叶更加符合工业企业的需求.[方法]以某乡镇79户烟农2020年交售的7个主要商业收购等级(B1F、B2F、B3F、C2F、C3F、C4F、X2F)共4150包烟叶为研究对象,依据烟叶质量及工业可用性的高低将7个商业收购等级分成22个工业等级,从“试验区”和“烟农”两个维度分析了商业收购等级质量和工业认可度之间的差异,探讨了影响烟农高可用性烟叶比例的原因.[结果](1)从工业企业角度看,在7个商业收购等级中,B1F
目的 研究空腹及餐后条件下单剂量依折麦布片的药代动力学特征,评价其生物等效性和安全性.方法 空腹组和餐后组各入组48例健康受试者,采用单中心、单剂量、空腹/餐后、随机、开放、两制剂、两周期、双交叉的试验设计,每周期受试者单次空腹或餐后口服受试药物或参比药物依折麦布片10 mg,用HPLC-MS/MS法测定给药后不同时间点受试者血浆中依折麦布和总依折麦布(依折麦布+依折麦布-葡萄糖醛酸结合物)的浓度.采用非房室模型计算药代动力学参数,评价2种依折麦布的生物等效性.结果 单次空腹给药受试药物与参比药物血浆中总
目的 研究Rho激酶抑制剂Y27632对脓毒症大鼠肠屏障功能障碍的影响及机制.方法 SD大鼠分为4组:假手术组、Y27632对照组、模型组、实验组,每组8只.以盲肠结扎穿孔法建立脓毒症大鼠模型,假手术组和Y27632对照组只进行开腹手术而不进行盲肠结扎和穿孔;Y27632对照组和实验组造模前15 min腹腔注射Y27632(5 mg·kg-1)干预,假手术组和模型组给予等量的磷酸盐缓冲溶液.造模24 h时,以苏木精-伊红(HE)染色观察大鼠小肠病理学变化,并进行小肠黏膜Chiu评分;以酶联免疫吸附(ELI
心脏病作为一种发病率和死亡率很高的疾病,严重威胁人类身体健康.斑马鱼作为模式生物,其成体心脏再生功能的发现,为研究和治疗心脏疾病拓展了新的视角.本文综述了多种斑马鱼心脏损伤模型,包括心尖切除损伤、冰冻损伤以及心肌细胞遗传消融模型等;并深入探讨了心脏再生过程中的关键生物学过程,包括多种信号通路在不同细胞类型的时序性激活、心肌细胞表观遗传学编程、冠状血管新生、发育相关关键转录因子的激活以及心肌细胞肌节结构的解离和重构等.对心脏再生机制的解析有望为人类心脏疾病的治疗提供新的思路和干预策略.
目的 比较高效液相色谱(HPLC)法和液质联用(LC-MS/MS)法测定人血浆中甲氨蝶呤(MTX)浓度的相关性.方法 收集接受大剂量MTX化疗后的患者的血液样品,分别用HPLC、LC-MS/MS法进行MTX血药浓度测定,通过Wilcoxon检验或配对t检验来比较2种测定方法在不同浓度范围的差异,通过压轴回归分析法建立回归方程.结果 2种方法的测定结果间比较差异有统计学意义(P0.05).回归方程:CLC-MS/MS=0.97CHPLC+1.32(r=0.99).结论 2种分析方法间相关性较好,可在临床实验
利用蕙兰(Cymbidium faberi)转录组数据设计了68对微卫星即简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)标记引物,从中筛选25对扩增稳定、多态性好的引物,并对41个大花蕙兰(C.hybridum)品种的遗传多样性进行了分析.结果显示:试验共扩增出187个条带,其中171条(占91.44%)为多态性条带,平均每对引物扩增多态性条带6.84条;平均每对SSR标记显示的多态性信息含量值和基因型数分别为0.7703和12.88.41份大花蕙兰种质资源之间的遗传相似系数为0.5