生防菌株PF-1基于全基因组数据的分类鉴定及拮抗能力分析

来源 :浙江农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：q7okl

【摘要】

：

基于全基因组数据,确定生防菌株PF-1的分类地位,验证其对植物病原菌的拮抗作用以及挖掘其潜在的生防功能。通过全基因组中16S rRNA基因序列的系统发育分析及基因组分析方法确

【作者】

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戚家明孙杉杉张东旭肖建中徐志文

【机构】

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领先生物农业股份有限公司,河北省农业生物技术创新中心,河北省农业农村厅植物营养与海洋功能肥料重点实验室,丽水学院生态学院

【出处】

：

浙江农业学报

【发表日期】

：

2020年10期

【关键词】

：

防御假单胞菌拮抗能力基因组基因簇 Pseudomonas protegensantagonistic abilitygenomegene cluster

【基金项目】

：

河北省产业创新创业团队(169A76114H),浙江省重点研发计划(2018C02031),浙江省自然科学基金(LY15C200012),丽水市高层次人才项目(2016RC01)

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基于全基因组数据,确定生防菌株PF-1的分类地位,验证其对植物病原菌的拮抗作用以及挖掘其潜在的生防功能。通过全基因组中16S rRNA基因序列的系统发育分析及基因组分析方法确定生防菌株PF-1的分类地位,通过平板对峙方法研究其对马铃薯枯萎病菌和棉花黄萎病菌的拮抗能力;利用antiSMASH软件分析和预测菌株PF-1的抗生素相关基因并挖掘其生防潜力。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析及基因组分析结果,PF-1被鉴定为防御假单胞菌(Pseudomonas protegens),同时发现PF-1基因组中

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