【摘 要】
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为探究高丹草杂种及其亲本间单核苷酸变异与其杂种优势形成的关系,以高丹草杂种及其亲本的根、茎和叶组织为试验材料,采用Illumina Hiseq 2000进行转录组测序。对平均长度达5
【机 构】
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内蒙古农业大学农学院,呼和浩特市种子管理站
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31160302,31460375);呼和浩特市科技计划项目(2012-重-计-8-2)资助~~
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为探究高丹草杂种及其亲本间单核苷酸变异与其杂种优势形成的关系,以高丹草杂种及其亲本的根、茎和叶组织为试验材料,采用Illumina Hiseq 2000进行转录组测序。对平均长度达58 122 160 bp的各测序样品序列信息进行检测后,均检测到不少于58 000个SNP位点,位于基因内的SNP个数显著多于位于基因间的SNP个数,SNP发生频率为1/741 bp,平均转换颠换比为1.00∶1.53。在所有变异类型中,C/T和G/A发生频率最高。经过筛选得到198(21%)个极显著偏向性等位基因表达偏向性S
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