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以7个栽培菌株为参照，采用ISSR分子标记技术对5个野生木耳属菌株进行分析，使用NTSYSpc2．1生物软件对12个供试菌株进行聚类分析，构建系统树。试验筛选出了11个扩增谱带清晰、多态性好的ISSR引物，共扩增出78条清晰易辨的多态性谱带。聚类分析结果表明，利用ISSR技术可将全部供试材料区分开，遗传相似系数变异范围为0．108~0．822，在相似系数为0．51时，12个菌株聚为6个群，其中5个野生菌株各自聚为不同类群，遗传差异较大。