【摘 要】
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膜蛋白是一类结构独特的蛋白质，是细胞执行各种功能的物质基础。根据其在细胞膜上的不同存在方式，主要分为六种类型。本文利用压缩的氨基酸对原始膜蛋白序列进行信息压缩，再对压
【基金项目】
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宁夏大学自然科学基金（ZR1124）项目资助.
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膜蛋白是一类结构独特的蛋白质，是细胞执行各种功能的物质基础。根据其在细胞膜上的不同存在方式，主要分为六种类型。本文利用压缩的氨基酸对原始膜蛋白序列进行信息压缩，再对压缩序列进行氨基酸组成和顺序特征的提取，最后采用支持向量机构建分类模型。通过五叠交叉验证的结果表明，该方法对于六种膜蛋白的分类预测，准确度最高可达98％以上，平均预测准确度在85％以上，可有效实现膜蛋白六种类型的划分，为进一步分析膜蛋白的结构和功能奠定基础。
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