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政府干预是艾滋病防控的主导环节,但是政府干预常常对公民自主权利造成一定的限制,其实质是公共健康与个人权利的冲突。这种冲突主要表现在艾滋病人的告知义务与婚姻自主权利之间的冲突;实名检测与隐私权利之间的冲突;强制检测与知情同意权利之间的冲突等。如何协调这些冲突,从而使公共健康与公民自主权利相互促进,是艾滋病防控的一个重要问题。