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科学技术的生产力功能以及新中国面临的国内外科技环境，决定了毛泽东必然选择自主创新来发展科技事业。在推动科技创新实践中，他注重从原则上宏观把握，其原则主要包括技术革命与制度革命相结合、自力更生与学中创新相结合、重点突破与全面跟进相结合等内容。毛泽东的科技自主创新思想，对党中央后来主要领导人产生了重大影响，具有深远的意义。