在定性研究科研经费投入与科技产出之间关系的基础上,构建模型定量分析了科技创新领军人才在科研经费投入产出中的作用,并以科研项目经费碎片化程度作为调节变量.采用中科院层面1997年到2015年共19年的时间序列数据,研究所层面从2008年到2015年共8年的面板数据,共197组,2167个数据进行实证分析.得到的主要结论有:第一,以中国科学院为样本,得到了其科技创新领军人才,在科研经费投入不变的情况下,当不存在项目碎片化时对产出的弹性系数为0.92,当存在项目碎片化时对产出的弹性系数为0.85,但领军人才没有规模效应;第二,得到了项目碎片化程度是影响经费使用效率的重要调节变量,项目碎片化程度对产出影响的弹性系数为-0.76,项目碎片化程度影响领军人才作用的发挥,会降低约8%的效果;第三,以30个研究所的数据为例,得到样本研究所科技创新领军人才的弹性系数,各研究所的排名可能会因主要从事基础研究和应用研究而有所差别,由于产出导向,相同条件下从事应用研究的院所要比主要从事基础研究的院所排名靠前;第四,如果没有战略,领军人才的增多反而会增加项目碎片化程度,表现为领军人才数量虽然多但发挥作用不明显;反之,项目碎片化程度也会降低领军人才的作用.