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棉花黑根腐病是甘肃省河西走廊棉区新发生病害之一。该病于1996年首先在敦煌市转渠口、杨家桥、七里镇等发现;2006年在金塔县航天镇、高台县黑泉镇发现;2007年在玉门市柳湖乡发现;近年来,已遍及敦煌、金塔、玉门、高台等主要植棉县(市)。虽然该病属于偶发性病害,但对棉花产量及品质会造成较大影响。