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广东内仃岛国家级自然保护区共有生维管植物１２７科３６７属５５１种，其中新种２个，广东新记录种１１个，国家濒危稀有植物３种；另有栽培植物约５０种，隶属于２１科３２属。内伶仃岛的经济植物资源非常丰富，共有用材树种６６种、药用植物４０５种、果类植物６０多种、淀粉植物２６种、油脂植物５５种、芳香植物４０多种、有毒植物８０种、鞣料植物３１种、纤维植物７９种、观赏绿化植物４０多种，猕猴食源植物２００多种。