核糖核酸酶Sa表面水和尿素分子的分布和动力学行为的分子动力学模拟

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利用分子动力学模拟研究了在不同尿素浓度下,核糖核酸酶Sa(RNase Sa)表面水和尿素分子的分布和动力学行为。结果表明,尿素分子可与RNase Sa酶形成较强的相互作用,并取代其表面的水分子而富集在蛋白质表面。尿素分子更倾向与RNase Sa酶的疏水残基作用,与RNaseSa酶主链形成氢键的能力更强。尿素分子的平动和转动远远慢于水分子的平动和转动。RNaseSa酶表面水分子的平动和转动随着尿素浓度增加而逐渐变慢,但RNaseSa酶表面尿素分子的动力学并不依赖于尿素浓度变化。本研究中明晰的RNase Sa
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