【摘 要】
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以231份来自世界各地的黄瓜核心种质为材料,于2017和2018年在北京和广州进行白粉病抗性鉴定,利用基因组重测序检测的950382个SNPs进行全基因组关联分析.结果 表明,黄瓜白粉病
【机 构】
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中国农业科学院蔬菜花卉研究所,农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京100081;广东省农业科学院蔬菜研究所,广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广州510640;南京农业大学园艺学院,作物遗传与
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以231份来自世界各地的黄瓜核心种质为材料,于2017和2018年在北京和广州进行白粉病抗性鉴定,利用基因组重测序检测的950382个SNPs进行全基因组关联分析.结果 表明,黄瓜白粉病在广州地区的自然发病率显著高于北京地区,不同种质在两年病情指数(DI)之间存在较高的相关性;基于混合线性模型,共检测到12个显著关联信号,分布于1号、5号和6号染色体上,其中,pm1.1在北京的两年中被重复检测到,pm5.7在广州的两年中被重复检测到;显著关联信号中共有68个超过阈值[log10(P value)=6.0]的SNP,包含1个外显子区非同义突变SNP (Chr5:16676542),位于编码异嗜性和多嗜性逆转录病毒受体蛋白基因XPR (Csa5G471600)上;在与白粉病抗性相关联SNP的LD区段内共检测到63个候选基因,其中7个候选基因的表达量在高抗材料接种白粉病前后出现显著差异.
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