以东洞庭湖区小型入湖河流、主洪道、主湖体为研究区域,于2016年9月分别设置12个代表断面进行氮、磷营养盐等环境因子及浮游植物调查。通过对氮磷营养盐形态结构、浮游植物群落结构及环境因子与浮游植物的RDA典范对应分析,探讨了秋季东洞庭湖蓝藻水华发生的风险水平。结果表明:（1）东洞庭湖ρ_TN为0.96¹.86 mg/L,平均1.58 mg/L,ρ_TP为0.065⁰.137 mg/L,平均0.101 mg/L,其中入湖河流的ρ_TN、ρ_TP最低。水体氮磷以溶解态为主,ρ_DTN/ρ_TN为88.5%,ρ_DTP/ρ_TP为56.0%,其中ρ_DIN/ρ_DTN为75.4%,ρ_PO34--P/ρ_DTP为80.5%,ρ_TN/ρ_TP为16.9;其中东洞庭湖藻密度为9×10⁴³25.2×10⁴个/L,平均72.6×10⁴个/L。（2）空间分布上,主湖体藻密度高于主洪道,主洪道及主湖体大部分水域优势属种为硅藻门的直链藻（Melosira sp.）,其中主湖体北部尾部水域大小西湖发生了蓝藻水华,其优势属种为蓝藻门的颤藻（Oscillatoria sp.）、鱼腥藻（Anabeana sp.）。（3）RDA分析表明TP与流速是影响东洞庭湖水体蓝藻生长的主要环境因子,其它环境因子也有一定的影响。（4）主洪道、主湖体已轻度富营养,秋季藕池河断流时段,主湖体发生蓝藻水华的风险较大,尤其大小西湖水域爆发蓝藻水华的风险极大,主洪道由于水体较为浑浊,流速较大,对藻类生长有抑制作用,发生蓝藻水华的风险较小。