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对矮慈姑的传粉过程及花粉流作出观察，用同工酶遗传标记法对其一个自然居群的异交率作出定量估计。在自然及人工居群中均观察到虫媒传粉，其中有较大比例的近距离传粉，末检出风媒花粉流。自交可育，同时存在雌雄同株和花序内雌雄花异熟等异交机制。我率估计结果（ｔ＝４９．９％）表明其交配系统为异交／自交兼性系统，作者认为，其较大比例的自交应归因于同株之不同克隆分株间交配的频繁发生。