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建设科技创新体系对促进南珠产业发展有着积极的意义，科学合理的科技创新体系评价指标有利于完善科技创新体系。论文运用创新理论界定南珠产业科技创新体系，从技术创新和制度创新两大模块设计南珠产业科技创新评价指标体系，并认为从产品生产、珠贝养殖、企业建设和产业管理体制等方面进行创新有利于促进南珠产业科技创新体系发展。