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随着水产养殖业不断壮大、发展，养殖密度及养殖产量不断的提高，一些问题也随之出现。首先，在我国养殖业大多为静水塘养环境下，高密度养殖造成大量的水产动物排泄物、残余饵料、消毒药剂等有机物沉积水底，有机物被分解释放出大量有害物质，使养殖水质环境恶化。其次，养殖密度增加，水体环境恶化，养殖病害也日益加剧，许多病害已经严重威胁养殖效益。再次，面对加剧的养殖病害，消毒剂、杀菌剂和化学药物的大量使用又带来了病菌的抗药性及药物残留等问题。