基于粗集的T细胞表位预测方法

来源 :计算机科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：llaaxzl123

【摘要】

：

T细胞表位预测技术对于减少实验合成重叠肽、研究病原体与机体作用的免疫机制以及深入理解T细胞介导的免疫特异性均有重要意义。为增强T细胞表位预测模型的可理解性,本文在通

【作者】

：

曾安潘丹郑启伦彭宏

【机构】

：

广东工业大学计算机学院,中国移动通信集团广东有限公司,华南理工大学计算机科学与工程学院

【出处】

：

计算机科学

【发表日期】

：

2007年6期

【关键词】

：

T细胞表位预测粗集规则获取 T cell epitope prediction Rough set Rule acquisition

【基金项目】

：

国家自然科学基金重点项目（No.30230350）、广东工业大学博士启动基金项目（No.063001）.

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T细胞表位预测技术对于减少实验合成重叠肽、研究病原体与机体作用的免疫机制以及深入理解T细胞介导的免疫特异性均有重要意义。为增强T细胞表位预测模型的可理解性,本文在通过肽的预处理构建出存储等长肽段的决策表之后,设计出了一种基于粗集的T细胞表位预测方法。该方法由基于信息熵的属性约简完备算法和基于锚点知识的属性值顺序约简改进算法共同组成。基于HLA-DR4（B10401）编码的MHCII类分子结合肽的实验数据表明,在预测精度与传统神经网络方法大致相当的基础上,本文方法可以提取出用于帮助专家理解MHC分子与抗原肽

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