【摘 要】
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二氢砒啶二羧酸还原酶(DAPB)是赖氨酸合成途径中的一个重要酶,在蛋白质和细胞壁的合成中起着重要作用.本研究基于KEGG总数据库分析表明,藜麦中DAPB的基因拷贝数远高于水稻、
【机 构】
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山西师范大学生命科学学院,临汾,041000;山西省农业科学院作物科学研究所,太原,030031
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二氢砒啶二羧酸还原酶(DAPB)是赖氨酸合成途径中的一个重要酶,在蛋白质和细胞壁的合成中起着重要作用.本研究基于KEGG总数据库分析表明,藜麦中DAPB的基因拷贝数远高于水稻、玉米及大豆等作物.对藜麦基因组数据筛选得到4个DAPB基因成员,均属于碱性蛋白质,氨基酸序列长度约330 bp,分子量为36.623～36.880 kD,等电点(pI)为5.79～6.01,最大疏水系数为0.028～0.123,为疏水性蛋白,亚细胞定位于细胞质中,不存在跨膜区.4个DAPB基因之间的Ka/Ks值均小于0.5,表明该基因在进化过程中比较保守.系统进化分析发现,藜麦DAPB家族成员位于同一个亚家族,且与菠菜的亲缘关系较近.启动子顺式作用元件分析结果显示,DAPB家族除含有TATA-box和CAAT-box以外,还含有多个参与激素响应、光照、低温及其它应激反应相关的顺式作用元件和转录因子结合位点,暗示藜麦DAPB家族成员可能参与以上多种响应.本研究分析了藜麦DAPB基因的拷贝数并对DAPB进行了生物信息学分析,可为进一步了解DAPB基因家族的生物学功能提供参考.
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