【摘 要】
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目的:探讨IGF2BP2通过调控基因表达和可变剪接在食管癌发生、发展中的作用机制。方法:在人食管癌细胞系ECA109中对IGF2BP2进行过表达,并进行转录组测序,通过分析IGF2BP2所调控的差异表达基因和可变剪接基因,探讨IGF2BP2在食管癌中的作用机制。结果:IGF2BP2过表达后引起158个基因显著差异表达,其中上调的基因有81个,下调的基因有77个(FC≥2or≤0.5,P<0.01)
【基金项目】
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新疆维吾尔自治区自然科学基金青年基金项目(2018D01C270);
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目的:探讨IGF2BP2通过调控基因表达和可变剪接在食管癌发生、发展中的作用机制。方法:在人食管癌细胞系ECA109中对IGF2BP2进行过表达,并进行转录组测序,通过分析IGF2BP2所调控的差异表达基因和可变剪接基因,探讨IGF2BP2在食管癌中的作用机制。结果:IGF2BP2过表达后引起158个基因显著差异表达,其中上调的基因有81个,下调的基因有77个(FC≥2or≤0.5,P<0.01),GO、KEGG分析发现IGF2BP2通过调控差异表达基因的方式来影响食管癌的发生、发展,可能并不显著。IGF2BP2过表达可变剪接水平发生显著变化的基因,在GO分析中富集到GPI 锚定生物合成过程,主要富集的信号通路是细胞增殖和细胞凋亡等。在细胞增殖中具有丰富意义的可变剪接基因,发现IGF2BP2过表达后21个(ADAMTSL4、TRIO、PLEKHG2等)在细胞增殖方面可变剪接的基因。在细胞凋亡中具有丰富意义的可变剪接基因,发现了23个(CDK11B、OSMR、MRE11A等)在IGF2BP2过表达后调控细胞凋亡的可变剪接基因。结论:IGF2BP2调控食管癌基因可变剪接促进其发生和发展。
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