【摘 要】
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目的 使用生物信息学在线预测软件分析细粒棘球绦虫重组蛋白zw-5氨基酸序列,研究该蛋白的理化特性,预测该蛋白的抗原表位,为Egzw-5作为候选疫苗分子提供理论依据.方法 应用DN
【机 构】
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宁夏医科大学总医院,宁夏银川,750004;宁夏医科大学医学科学技术研究中心,宁夏银川,750004;宁夏医科大学总医院医学实验中心,宁夏银川,750004
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目的 使用生物信息学在线预测软件分析细粒棘球绦虫重组蛋白zw-5氨基酸序列,研究该蛋白的理化特性,预测该蛋白的抗原表位,为Egzw-5作为候选疫苗分子提供理论依据.方法 应用DNAStar、EXPASY/SignalP等在线生物分析软件对Egzw-5的二级结构、抗原表位、信号肽、极性、三维结构等进行模拟.结果 Egzw-5基因开放阅读框编码一个由207个氨基酸残基组成的多肽,重组Egzw-5分子含207个氨基酸,分子量为2.38kD,等电点为pI为4 98.其中带有负电荷的氨基酸有37个(天冬氨酸和谷氧酸),带有正电荷的氨基酸共有26个(赖氨酸和精氨酸).其分子式为C1041H1674N284O329S14,共含有3342个原子.在280nm处的消光系数为6085,吸光度0.1％为0.255.在哺乳动物中的半衰期为30h.不稳定系数为57.62,脂溶指数为84.88.不存在分泌型信号肽,也无跨膜结构无细胞核线粒体溶酶体和过氧化酶体等亚细胞定位序列.该蛋白空间结构不规则,含有线性B细胞表位,N端与C端位于表面.结论 Egzw-5有望作为新的候选疫苗分子进行进一步的研究,其具体的免疫机制仍需进一步的实验进行验证.
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