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为了解植物不同倍性之间的表观遗传差异，对3个西瓜（Citrullus lanatus）品种克西、中金和枚选的纯合二倍体和同源四倍体进行甲基敏感扩增多态性（MSAP）分析，10对引物共扩增546条带，其中，二倍体较同源四倍体材料之间有3条特异性条带，这些特异性条带无品种差异，系倍性不同所致。带型变化表明，同源四倍体较二倍体有DNA甲基化减少和单链甲基化增加现象，但从DNA甲基敏感多态性差异上来看，品种内二倍体和同源四倍体间的DNA甲基敏感多态性差异不大，仅0．02％左右。