口蹄疫病毒全基因组序列特征分析

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对口蹄疫病毒全基因组序列特征的分析有助于了解口蹄疫病毒复制、翻译等生命活动的相关机制。利用DNAStar和DNAMAN软件,对249株口蹄疫病毒全基因组序列进行了比对分析。结果表明,口蹄疫病毒ORF的长度为5 982~7 020bp,平均长度为6 975bp,编码1 994~2 340个氨基酸。各基因的核酸序列同源性均在74%以上,最高达到94.29%。在5′-UTR存在大量保守位点,并发现3个长的保守序列。3′-UTR区存在4段保守序列,可以形成2个发卡结构。研究结果为进一步研究口蹄疫病毒基因组序列结构
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