【摘 要】
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目的利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘心肌肥厚的枢纽基因,并在动物中初步验证。方法从基因表达综合数据库(GEO)中下载心肌肥厚的全基因组表达数据GSE36961,数据初处理
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(81473234),广东省科学技术厅产业技术研究与开发专项资助项目(20160908),广东省基础与应用基础研究基金资助项目(2019A1515012215)
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目的利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘心肌肥厚的枢纽基因,并在动物中初步验证。方法从基因表达综合数据库(GEO)中下载心肌肥厚的全基因组表达数据GSE36961,数据初处理后,用WGCNA构建共表达网络,识别与心肌肥厚发生相关的模块,并针对关键模块内基因进行功能注释(GO)和KEGG信号通路分析,利用可视化筛选枢纽基因,最后在心肌肥厚大鼠模型中初步验证枢纽基因。结果在GSE36961中Blue模块和Turquoise模块与心肌肥厚相关性最高(相关系数分别为0.83和-0.81),模块基因分别富集
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