2010年4月，“深水地平线”油井泄漏事故发生后，约40万吨甲烷流入墨西哥湾。许多科学家担忧这些甲烷会对该地区的生态环境造成长期影响。但后来，研究者惊讶地发现以沼气为生的细菌在当年8月之前就已经将这些污染物基本处理完毕。
　　但是，一项新研究显示，沼气细菌只能处理约一半沼气。美国俄亥俄州佐治亚大学微生物地球化学家兼海洋学家Samantha Joye领导的研究小组分析了2010年3月～12月10个墨西哥灣考察队收集的1000多个水样。
　　他们发现，泄漏事故两周后，甲烷氧化率开始上升，这表明细菌处理甲烷的速度正在加快。但之后，该速率开始降低，从最高点下降了1～2个数量级。
　　该小组认为，之前，该区域缺乏能处理沼气的细菌。事故发生后，沼气细菌开始急速繁殖，导致氧化率快速上升。此后，由于种群数量过度增长，沼气细菌的生存压力也变大。
　　一方面由于其他细菌也争夺沼气，另一方面，沼气细菌只能在沼气含量较高的环境下生存，因此随着沼气细菌数量的减少，氧化率也开始下降。
　　但加州大学圣塔巴巴拉分校微生物地球化学家David Valentine坚持认为，沼气细菌能将污染区域的沼气清理完毕。他指出，Joye的研究样本都是从近海水域收集到的，只占沼气总量的1%，而污染中心区域的样本并没有纳入其中。罗彻斯特大学海洋化学家John Kessler也认为，该研究没有反映出全部情况，因为泄漏出的沼气量很大且分布不均匀，所以沼气氧化率在不同位置不同时间内的高低也会有差异。