目的探讨电子胃镜+超声内镜与超声内镜引导下多部位细针穿刺抽吸术(EUSFNA)对胃肠间质瘤(GIST)的诊断效果。方法选取2012年2月至2013年11月间收治的疑似GIST患者76例,按检查方法不同分为两组,即电子胃镜×超声内镜组(甲组)和EUS-FNA组(乙组),每组38例,两组患者均经病理诊断后行手术治疗,同时活检。统计诊断结果、并发症和患者对检查满意度。结果甲组GIST检出率为63.2%,乙组为68.4%;甲组并发症发生率为31.6%,乙组为39.5%;甲组GIST准确率为70.6%,乙组为74.3%;甲组良性GIST准确率为80.0%,乙组为85.7%;甲组交界性GIST准确率为62.5%,乙组为78.6%;甲组恶性GIST准确率为76.9%,乙组为64.3%。两组以上指标比较,差异无统计学意义(P>0.05)。甲组满意度为39.5%(15/38),乙组为63.2%(24/38),差异有统计学意义(P<0.05)。结论电子胃镜+超声内镜检查与EUS-FNA诊断GIST的准确性差异无统计学意义,但在GIST分型诊断中和患者接受度方面,GUS-FNA优于电子胃镜+超声内镜。