目的：研究肛肠疾病手术切口感染的病原菌及相关的危险因素。方法选取我院2013年3月至2015年3月期间收治的259例进行肛肠疾病手术患者作为研究对象，统计肛肠疾病手术切口感染的患者例数，并且分析切口感染病原菌的特点。结果259例行肛肠疾病手术的患者中，共有54例患者出现了手术切口感染，感染率为20.85%。其中痔疮手术切口感染35例，肛瘘手术切口感染11例以及肛裂手术切口感染8例。对54例肛肠疾病手术切口感染患者的病原菌进行分离培养，共分离培养出36株，阳性率为66.67%，其中革兰阴性菌、革兰阳性菌、真菌的占比分别为80.56%、12.82%和5.56%。革兰阴性菌主要包括大肠埃希菌、克雷伯菌属、变形菌属以及肠杆菌属；革兰阳性菌主要包括表皮葡萄球菌和肠球菌属。另外，患者的年龄、手术时间以及体重指数都是肛肠疾病手术切口感染的重要因素。结论肛肠疾病手术后，患者的切口容易发生感染，而感染的主要病原菌为革兰阴性菌、革兰阳性菌以及真菌，患者手术时间、体重指数以及年龄是切口感染的危险因素，通过采取合理的措施，能够有效的降低肛肠疾病手术切口感染率。