【摘 要】
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目的探讨乳腺癌上皮细胞与外周血之间的交互作用。方法从GEO数据库中获取乳腺癌上皮细胞及外周血单个核细胞(PBMCs)表达谱。GEO2R在线分析工具筛选差异表达基因,利用Uni Prot
【机 构】
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四川省肿瘤医院,成都医学院生物医学系
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目的探讨乳腺癌上皮细胞与外周血之间的交互作用。方法从GEO数据库中获取乳腺癌上皮细胞及外周血单个核细胞(PBMCs)表达谱。GEO2R在线分析工具筛选差异表达基因,利用Uni Prot和STRING数据库对差异表达基因蛋白产物进行亚细胞定位,筛选乳腺癌细胞分泌蛋白及与其相互作用的PBMCs膜蛋白。Cytoscape软件构建互作网络。使用DAVID在线工具基因功能注释和KEGG通路富集方法对互作分子进行分析。结果共筛选到101对相互作用分子,基因功能主要涉及细胞黏附、细胞迁移、白细胞激活、免疫反应等生物学过程,参与的信号通路主要有细胞外基质—受体相互作用,细胞因子—细胞因子受体相互作用,趋化因子信号通路等。其中FN1、ITGBI、FLT1、COMP、CXCL12为关键蛋白。结论利用生物信息学方法,整合组学数据,能够有效获取信息,为乳腺癌的治疗及预后监测的研究开辟新思路。
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