【摘 要】
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目的 利用生物信息学方法研究细胞分裂周期相关蛋白(CDCAs)介导乳腺癌的潜在靶向基因、信号传导通路及分子机制.方法 从GEO和TCGA数据库下载正常乳腺组织和乳腺癌样本的基因芯片;使用R软件limma包分析正常乳腺组织和乳腺癌样本之间的差异表达基因;使用Kaplan-Meier Plotter评估乳腺癌患者的整体生存率、无复发生存率和无远处转移生存率;对筛选出的差异表达基因进行GO和K EGG信号通路富集分析.结果 通过对差异表达基因的趋势分析,筛选出2015个显著上调的基因以及864个显著下调的基因,
【机 构】
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兰州大学第一临床学院,兰州 730000;甘肃省妇幼保健院妇幼保健科研中心,兰州 730050;甘肃省妇幼保健院乳腺一科,兰州 730050;兰州大学第一临床学院,兰州 730000;兰州大学第一医院
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目的 利用生物信息学方法研究细胞分裂周期相关蛋白(CDCAs)介导乳腺癌的潜在靶向基因、信号传导通路及分子机制.方法 从GEO和TCGA数据库下载正常乳腺组织和乳腺癌样本的基因芯片;使用R软件limma包分析正常乳腺组织和乳腺癌样本之间的差异表达基因;使用Kaplan-Meier Plotter评估乳腺癌患者的整体生存率、无复发生存率和无远处转移生存率;对筛选出的差异表达基因进行GO和K EGG信号通路富集分析.结果 通过对差异表达基因的趋势分析,筛选出2015个显著上调的基因以及864个显著下调的基因,其中CDCA1/2/3/5/7/8可能为介导乳腺癌浸润性进展的相关基因.生存分析表明,乳腺癌CDCA1/2/3/5/7/8高表达与不良预后相关(均P<0.05).GO分析结果主要富集于细胞有丝分裂周期、染色姐妹单体分离、染色体、着丝粒、纺锤体等;KEGG信号通路富集分析则在卵母细胞减数分裂、p53信号通路、DNA复制显著富集.结论 整合生物信息学分析结果,表明CDCAs在乳腺癌组织中表达升高,并且CDCAs表达水平显著影响乳腺癌患者预后,与其他CDCAs相比,CDCA2/3/5/8可能是乳腺癌患者靶向治疗的合适靶点.
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