新疆维、汉人群CD14基因单核苷酸多态性的连锁不平衡和单倍型分析

来源 :新疆医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zgrmxm
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目的研究CD14基因-159-、1359r、s2569192 3个单核苷酸多态性(SNP)的发生频率在新疆维吾尔族(维族)、汉族人群是否存在连锁不平衡关系及其单倍型组成。方法应用SNaPshot SNP分型技术对新疆地区维族、汉族300例(维、汉族各150例)健康个体CD14基因-159C/T-、1359T/Gr、s2569192G/C 3个SNP位点进行基因分型,分析3个位点间的连锁不平衡关系,计算它们构成的单倍型。结果 CD14基因-159C/T-、1359T/G、rs2569192G/C 3个SNP位点基因型频率分布符合H-W平衡。新疆维族和汉族的等位基因发生频率差异无统计学意义(P>0.05)。通过对这3个SNP位点两两间进行连锁不平衡分析,发现连锁不平衡系数|D’|值都为1。3个SNP主要组成4种单倍型:TGC、CTC、CGG、CGC,维、汉族单倍型频率比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论新疆地区维、汉人群CD14基因-159C/T-、1359T/Gr、s2569192G/C 3个SNP位点呈完全连锁不平衡。TGC是维、汉族人群的主要单倍型。为新疆地区维、汉族人群CD14基因3个SNP的群体遗传学资料,并且为寻找与CD14相关疾病单倍型奠定了基础。
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