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禽流感主要通过水平传播，即通过易感禽类与感染禽类，的直接接触或与病毒污染物的间接接触，例如被污染的饮水、飞沫、饲料及其蛋筐、蛋盘、气管、气囊、鼻腔、眼结膜、口腔、泄殖腔、腹腔及静脉等途径感染鸡群。因此自然传播中通过消化道、呼吸道、眼结膜及损伤皮肤等都有可能受到感染。禽流感病禽可以从呼吸道、结膜和消化道排出病毒，感染方式包括呼吸道感染、机械性传染。目前为止，还未有证据表明禽流感有垂直感染的传染途径（种鸡-种蛋-雏鸡）的危险性，但种禽场的禽类受到感染时，所产的蛋和孵出的雏禽，应全部销毁。