【摘 要】
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利用高通量测序对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚钙调素结合蛋白(CaMBP)基因序列。采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性
【基金项目】
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国家自然科学基金(31360477),广西教育厅项目(2013YB036)
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利用高通量测序对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序,通过差异分析得到了沙田柚钙调素结合蛋白(CaMBP)基因序列。采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明该基因全长为1616 bp,开放阅读框(ORF)全长为1368 bp,编码455个氨基酸,编码蛋白质的分子量为50.11 KDa,理论等电点为5.33。该蛋白质含有一个与钙调素结合蛋白相同的保守结构域。氨基酸序列比对结果显示,其编码的蛋白质与克莱门柚(Citrus cleme
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