爆发性传染性疾病流行期间,尽早开展流行病学和临床诊疗数据的汇集、分析及相关研究至关重要。新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在中国及其他国家的流行从方法学角度为研究传染病提供了重要的契机。本文提出疫情期间进行病例报告、临床随机对照试验、基于真实世界数据的研究和卫生经济学研究方法的考量。病例报告在传染病爆发期间扮演重要角色,疫情期间病例报告的发表应该重视写作规范和同行评议程序。疫情期间治疗有效性的金标准仍是开展临床随机对照试验,本文总结了在疫情爆发期间开展临床随机对照试验会面临的诸多挑战。在疫情爆发流行期间,各定点收治医院对患者实际诊疗所形成的真实世界数据,在验证疫情相关医学干预措施的安全性和有效性方面显示出一定优势。卫生经济学研究对优化传染病防控策略提供数据支撑有重要意义,本文对传染病爆发期间的卫生经济学研究方法、研究设计、技术要点进行总结。本文建议提前将临床研究和卫生经济学研究纳入到爆发性传染性疾病的防治规划中,兼顾标准与可行性,以提高对传染病爆发的应对能力。