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目的
利用基因芯片筛选心房颤动(AF)患者心房组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNAs)和信使RNA(mRNAs),并对其进行初步阐述。
方法2014年1月至2014年6月应用芯片技术检测南通大学附属泰州市人民医院3例AF患者心房组织和3例正常对照心房组织的lncRNAs和mRNAs表达,筛选出差异表达的基因,对其进行基因本体论(Gene Ontology,GO)、生物学途径分析(pathway analysis)。
结果差异表达的lncRNAs 219条,上调的156条,下调的63条。差异表达的mRNAs 197条,上调的120条,下调的77条。GO分析提示差异表达的mRNAs主要富集于酪氨酸蛋白激酶活性、钙离子结合、DNA结合等生物学途径。差异表达的mRNA在细胞黏附分子、细胞核因子-κB信号通路、Ras信号通路等方面有着显著变化。
结论房颤患者大量差异表达的lncRNAs和mRNAs,提示差异表达的lncRNAs与AF的发病机制可能相关。