【摘 要】
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基因测序技术在过去的二十几年里取得了突飞猛进的发展,随着以高通量,短读取,低成本为特点的新一代基因测序技术的问世,测序一个物种全基因的时间和成本大大降低。基于下一代
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(G61174163)
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基因测序技术在过去的二十几年里取得了突飞猛进的发展,随着以高通量,短读取,低成本为特点的新一代基因测序技术的问世,测序一个物种全基因的时间和成本大大降低。基于下一代测序技术的全基因组装算法和软件相继开发出来,目前比较成熟的基因组装算法大约有二十种左右。由于基因组装问题本身的复杂性,目前还没有针对不同组装算法的具体设计步骤,操作环境,应用范围等方面的调研。基于此本文简要调研了现有的十二种具有代表性的基因组装算法,系统的分析了每种算法的设计步骤,算法原理,操作环境以及应用。这篇调研对于如何设计基因组装算法,对
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