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采集日本冲绳源河川和边野古川的日本绒螯蟹样品参考果蝇与蚤状线粒体ＤＮＡ１２ｒＲＮＡ基因片段序列进行了其相同片段的引物设计、ＰＣＲ扩增及序列测定。结果表明冲绳两河川４只日本绒螯蟹的碱基序列完全相同，为４５８ｂｐ，其Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ含量分别为１６０ｂｐ（３４．９４％）、１７９ｂｐ（３９．０８％）、４９ｂｐ（１０．７０％）、７０ｂｐ（１５．２８％）同果与蚤状蚤相同基因片段的序列含量相似。