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多元主体协同创新是一个复杂的动态系统工程,利用演化博弈方法能够从动态视角分析多元主体协同创新运行机理,从根本上探究影响协同创新稳定性的因素。本文基于国家创新驱动发展战略纲要的要求,构建"环境驱动"和"创新驱动"的多元主体协同运行机制,并据此构建博弈模型分析协同创新中各创新主体的博弈策略选择,利用雅克比矩阵判断其策略稳定性。演化博弈结果显示:在创新主体利益诉求得到满足的情况下,多主体协同系统能够保持系统稳定;创新主体之间知识势差与协同创新稳定性呈反比;良好的协同效应、独立的内部监督机制等能有效的促进协同创新系统稳定。