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根际土壤微生物群落结构是根际微生态系统中的重要组成部分，与根际养分有效性、植物生长发育及抗病性等关系密切，不同植物间、同一植物的不同基因型之间根际微生物群落结构差异较大。利用从两种基因型大豆根际土壤中直接提取和从平板培养菌落提取的微生物DNA为模板，采用细菌通用引物GC-357f和517r进行PCR扩增，对PCR产物的DGGE图谱进行聚类和主成分分析。结果表明，不同基因型大豆根际土壤未培养的细菌群落结构差异不大，而在土壤浸提液和NA培养基上形成的可培养的细菌群落结构受培养基种类和接种浓度（101和101）