转录因子Bach1在小鼠胚胎发育时期的生物信息学分析

来源 :复旦学报:医学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：my888162

【摘要】

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目的研究转录因子Bach1在小鼠胚胎发育时期的表达情况并对其表达和调控机制进行生物信息学分析。方法获取小鼠胚胎发育不同时期的转录组数据[来自Gene Expression Omnibus(GE

【作者】

：

吕晓宇王新红孟丹

【机构】

：

复旦大学基础医学院生理与病理生理学系

【出处】

：

复旦学报:医学版

【发表日期】

：

2020年3期

【关键词】

：

Bach1 胚胎 WGCNA 基因表达小鼠 Bach1embryoWGCNAgene expressionmouse

【基金项目】

：

国家自然科学基金重大研究计划培育项目(91639103),国家自然科学基金(81670450,81873469,81873536)

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目的研究转录因子Bach1在小鼠胚胎发育时期的表达情况并对其表达和调控机制进行生物信息学分析。方法获取小鼠胚胎发育不同时期的转录组数据[来自Gene Expression Omnibus(GEO)数据库GSE92634],使用权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法进行分析。利用来自10个小鼠胚胎样品的8933个基因构建17个共表达模块,并对含有Bach1特定模块的共表达基因进行Gene Ontology(GO)功能

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