【摘 要】
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为了更深入开展珊瑚遗传结构及其多样性研究,本研究采用高通量测序对鹿角杯形珊瑚进行微卫星标记的开发.首先用人工白化的方法获得污染较低的鹿角杯形珊瑚,然后使用该样品DNA
【机 构】
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广西大学 珊瑚礁研究中心,广西 南宁 530004;广西南海珊瑚礁研究重点实验室,广西 南宁 530004;广西大学 海洋学院,广西 南宁 530004;广西大学 林学院,广西 南宁 530004
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为了更深入开展珊瑚遗传结构及其多样性研究,本研究采用高通量测序对鹿角杯形珊瑚进行微卫星标记的开发.首先用人工白化的方法获得污染较低的鹿角杯形珊瑚,然后使用该样品DNA,基于高通量测序平台对鹿角杯形珊瑚简化基因组进行了测序,最终设计得到鹿角杯形珊瑚微卫星引物2786对.利用海南三亚鹿角杯形珊瑚对其中6对多态性较高的微卫星标记进行了评价.每个微卫星位点的有效等位基因数(Ne)为2.198～5.000;观测杂合度(Ho)为0.531～0.875;期望杂合度(He)为0.512～0.816;Shannon多样性指数为0.856～1.829;多态信息含量(PIC)为0.441～0.777,其中有4对微卫星标记呈现为高度多态性(PIC>0.5),2对微卫星标记为中度多态性.经过Bonferroni校正后,只有微卫星标记LB11偏离哈迪—温伯格平衡;连锁不平衡检验结果表明,位点之间不存在连锁不平衡现象.
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