大肠杆菌和志贺氏菌O-抗原糖基转移酶与聚合酶的生物信息学研究

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利用生物信息学手段对大肠杆菌和志贺氏菌的110个O-抗原糖基转移酶与39个O-抗原聚合酶的序列进行分析,探讨这两种酶的序列和结构特点.统计了其序列一致性,密码子使用和(G+C)%含量的特点;讨论了O-抗原糖基转移酶和聚合酶对底物的特异性;推测了6组糖基转移酶的功能;通过对蛋白拓扑结构的预测,发现O-抗原聚合酶中广泛存在一个位于细胞周质中的亲水环(Loop),是可能的功能区域;通过对蛋白高级结构的预测,发现O-抗原糖基转移酶属于两个不同的蛋白超家族.
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