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18个品种136个个体的mtDNAcyt6基因全序列不存在长度差异(1140bp),均以ATG为起始密码子,中间无插入、缺失或终止密码子,以终止密码子AGA结束;一共检测到了105个替代突变位点,约占核苷酸总数(1140bp)的9.2%.核苷酸多样性(Pi)为0.00923,一共定义了47个cyt6基因单倍型,单倍型多样性为0.848.105个突变位点中有65个转换和39个颠换,参考序列V00654的15615位点为中国黄牛cyt6基因变异的转换与颠换共存位点.北方黄牛(0.00550±0.00