肾透明细胞癌基因表达谱芯片的生物信息学分析

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目的 利用生物信息学的方法分析肾透明细胞癌(ccRCC)相关基因功能富集、通路及关键基因的临床意义。方法 从TCGA和GEO下载ccRCC的RNA测序数据和芯片数据,利用R语言筛选出差异基因。然后利用metascape进行通路和功能富集,利用STRING 网站和 Cytoscape 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,同时从PPI网络中筛选出关键基因。最后利用OncoLnc网站对CCL5、TYROBP、LILRB2和MMP9做生存分析。结果 总共筛选出660个差异基因,这些差异基因与白细胞
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