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目的对应用双向腔静脉肺动脉吻合术对患有复杂先天性心脏病的患者进行治疗的临床效果进行研究分析。方法抽取72例患有复杂先天性心脏病的患者病例,将其分为对照组和治疗组,平均每组36例。采用传统手术方式对对照组患者进行治疗;采用双向腔静脉肺动脉吻合术对治疗组患者进行治疗。结果治疗组患者复杂先天性心脏病治疗效果明显优于对照组;手术操作用时和术后恢复用时明显短于对照组;围手术期不良反应明显少于对照组。结论应用双向腔静脉肺动脉吻合术对患有复杂先天性心脏病的患者进行治疗的临床效果非常明显。