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研究对2011年7月采自印度尼西亚卡利安达岛近岸热泉的样品，进行了细菌和古菌16S rRNA基因和细菌氢酶基因克隆文库的构建、序列测定和多样性分析。结果表明：热泉系统的细菌和古菌由16个门组成，Proteobacteria 为热液流体和沉积物的优势类群，丰度分别为59．5％和73．3％，Cya-nobacteria 为菌苔的优势类群（丰度，56．5％）；具有氨氧化作用的 Crenarchaeota 为古菌的优势类群。热泉系统中，70％以上的种类与海洋细菌的亲缘关系最近，说明该系统具有海洋特性；约20％的种类与陆地热泉中嗜热或中等嗜热细菌的亲缘关系最近，这些种类可能来源于高温地层内部，并参与了铁氧化还原、氢氧化、硫氧化和硝酸还原等过程。热泉系统中，NAD（P）－关联的双向 NiFe－氢酶基因和 FeFe－氢酶基因的组成分布也受到温度和盐度分布变化的影响。研究为揭示浅海热液系统提供理论参考。