【摘 要】
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目的：研究轮状病毒流行本NSP4基因变异特征。方法：对2015年7-11月从云南省昭通市获得的6本人轮状病毒流行本的NSP4基因用RT-PCR进行扩增,并进行测序,测序结果应用DNAassist和Clustal-mp以及MEG4.0软件进行序列分析,通过昭通毒本RV NSP4基因与来自GenBank Database的4本人RV(Wa、Hochi、KUN、AU-1)和3本动物RV(OSU、SAll
【机 构】
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昭通市第一人民医院儿科 云南昭通 657000
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目的：研究轮状病毒流行本NSP4基因变异特征。
方法：对2015年7-11月从云南省昭通市获得的6本人轮状病毒流行本的NSP4基因用RT-PCR进行扩增,并进行测序,测序结果应用DNAassist和Clustal-mp以及MEG4.0软件进行序列分析,通过昭通毒本RV NSP4基因与来自GenBank Database的4本人RV(Wa、Hochi、KUN、AU-1)和3本动物RV(OSU、SAll、EW)及我国不同地区的45本A组轮状病毒NSP4基因进行比较。
结果：昭通地区6本轮状病毒本的NSP4基因都为Wa型,与来自Genbank Database的4本人RV (Wa、Hochi、KUN、AU-1)和3本动物RV(OSU、SAll、EW)氨基酸同源性分别为95.7％、94.2％、86.4％、84.8％和91.2％、82.3％、48.3％,与中国各地区流行本同源性均在86.4％以上,据此可将51本RV NSP4分为2组,分别以Wa本和KUN本为代表,其中以Wa组为主,组内同源分别为92.6％-100％和96.5％-100％。氨基酸进化树提示在Wa组内包括3个亚组。
结论：6个昭通地区轮状病毒本的NSP4基因都为Wa型。我国流行本NSP4基因主要可分为Wa组及KUN组,NSP4的变异与年份有关而与地域关系不密切。
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