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目前国内外桃育种以常规杂交育种为主，杂种群体大，需占用相当面积的土地，且存在3年左右的童期，育种周期较长，选育效率较低。采用DNA标记技术标记控制果树重要性状的基因，然后采用与目标基因连锁的分子标记对杂种后代进行分子标记辅助选择（Marker assisted selection，MAS），不仅可以节约大量的土地，而且可以缩短育种年限，提高育种效率。