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棉花杂种优势的高低与亲本的纯合性有着密切的关系。据中国农科院棉花研究所研究，混杂退化的亲本配制的杂交种比纯度高亲本配制的杂交种优势下降8％～10％。棉花是常异交作物，异交率一般为8％～10％。根据田间实际测定，棉花在田间的异交率在13％-14％。所以，杂种利用中必需对亲本材料进行保纯，以保持亲本材料的纯合性。为此，必须人为地对棉花实行自交。而在棉花花粉管通道法转化外源基因时．要求棉花花朵在微量注射前先自交，