应用生物信息学寻找大鼠中新的microRNA分子及其实验验证

来源 :华东师范大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:alexiss
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大鼠已公布的microRNA(miRNA)数量明显少于小鼠及人miRNA的数量.本文采用同源搜索的计算方法预测大鼠新的miRNA.从miRBase数据库中下载已知动物的pre—miRNAs,在UCSC数据库中对大鼠的全基因组序列进行了Blat分析,并根据miRNAs的筛选标准,获得45条新的大鼠miRNAs;随后随机选取其中的9条新miRNAs进行RT—PCR实验验证,发现大部分miRNAs在脑、心、肺、肾、肌肉、脾、睾丸和肝8种组织中均有表达.在此基础上,对预测的新miRNAs进行了miRNA成簇分析和
其他文献
研究给定最大度的树在移接变形下的代数连通度的变化.这些结果可以用来刻画给定最大度和顶点个数的树中具有最小代数连通度的极图,并且给出了该极图的代数连通度的一个下界.
近年来,皮质醇能够导致认知缺陷已经在动物实验和人类中得到证实,而且研究中都观察到了糖皮质激素剂量与认知缺陷程度之间存在倒"U"字曲线关系.进一步的研究发现脑中存在盐皮
目的:总结血管内支架成形术治疗高危颈动脉狭窄患者的可行性和安全性及短期疗效.方法:自2000年10月至2001年12月,共采用血管内支架植入术治疗高危颈动脉狭窄患者26例,其中7例
以上海市某黑臭河道为研究对象,模拟水生植物在天然水体中的生态位.采用香菇草、睡莲和轮叶狐尾藻3种水生植物,并采用逐级下沉的运行方式,构建立体生态系统——梯级生态浮床.
烤烟双层施肥试验金学谦(陕西合阳县烟草公司715300)烤烟是一种对肥料反应敏感,但又必须严格控制养分分解吸收过程和阶段吸收量的叶用经济作物,在烟叶栽培过程中,施肥的总量、肥种、方法
目的:分析军人心理问题的自我评估结果及其影响因素。方法:随机选择362名军人,采用症状自评量表(self-re-porting inventory)SCL-90(symptom checkist-90)独立评估自我身体、情绪、认
文章全面总结了锡林郭勒盟喷灌圈马铃薯发展的现状,分析了喷灌圈马铃薯生产过程中存在的问题,针对这些问题提出对策,从而为锡林郭勒盟喷灌圈马铃薯产业的健康发展提供决策依
目的:探讨大肠肿瘤组织中细胞凋亡及增殖细胞核抗原(PCNA)表达与其生物学行为的关系.方法:应用免疫组化S-P法及凋亡细胞TUNEL检测法检测10例正常大肠黏膜、15例大肠腺瘤和62
前列腺特异抗原(PSA)作为检测前列腺癌的有效指标在临床中被广泛应用,但对低水平PSA前列腺癌患者则易漏诊.本文分析了我院1994年1月至2000年4月收治的73例前列腺癌中PSA<10.0
宫内感染是引起早产的重要因素之一.近年的研究发现白细胞介素6(IL-6)与早产关系密切.羊水中IL-6作为一项敏感的生物指标可预测亚临床感染性早产,高水平羊水IL-6预示保胎失败