刺槐Genomic-SSR与EST-SSR遗传差异性分析

来源 :中国农学通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：fenghuah

【摘要】

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为在刺槐育种研究中合理选用不同来源的SSR分子标记,选取12个刺槐个体,试剂盒提取DNA后分别利用9对Genomic-SSR引物和9对EST-SSR引物进行扩增,并采取毛细管电泳检测扩增产物

【作者】

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董黎张江涛文彦忠牛东升田书勇孙宇涵李云

【机构】

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林木育种国家工程实验室/北京林业大学生物科学与技术学院,河南省林业科学研究院,吉县林木良种繁育场,国有冠县苗圃

【出处】

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中国农学通报

【发表日期】

：

2019年19期

【关键词】

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刺槐 GENOMIC-SSR EST-SSR 遗传相似系数遗传差异性 black locust Genomic-SSR EST-SSR genetic sim

【基金项目】

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北京林业大学重大科研成果培育项目“刺槐种质资源评价、品种选育与产业化应用”(2017CGP007),林业公益性行业科研专项“刺槐属种质资源收集保存与创新利用研究”(201304116),国家林业局科技发展中心项目“北林槐1号新品种转化应用试点”(XPC-2015-3),中央高校基本科研业务费专项资金资助“重要生态抗逆树种育种与高效繁殖技术”(2016BLPX13),国家林业局科技推广项目“四倍体刺

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为在刺槐育种研究中合理选用不同来源的SSR分子标记,选取12个刺槐个体,试剂盒提取DNA后分别利用9对Genomic-SSR引物和9对EST-SSR引物进行扩增,并采取毛细管电泳检测扩增产物。利用所得条带信息及相关软件对2种SSR分子标记进行多态性、遗传相似系数相关性以及聚类等方面的比较分析。结果显示,刺槐Genomic-SSR平均检测到的条带数为6、Shannon多样性指数为1.3833、观测杂合度为0.5749、期望杂合度为0.6832;EST-SSR平均检测到的条带数为5.1、Shannon多样性指

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